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据学术活动的需要，中国核学会设立了五十一个专业分会：（按成立时间排序）
- ?核化学与放射化学分会
- ?核物理分会
- ?核电子学与核探测技术分会
- ?原子能农学分会
- ?辐射防护分会
- ?核医学分会
- ?核化工分会
- ?铀矿冶分会
- ?核能动力分会
- ?粒子加速器分会
- ?核材料分会
- ?铀矿地质分会
- ?辐射研究与应用分会
- ?同位素分离分会
- ?核聚变与等离子体物理分会
- ?计算物理分会
- ?同位素分会
- ?核技术经济与管理现代化分会
- ?核科技情报研究分会
- ?核技术工业应用分会
- ?脉冲功率技术及其应用分会
- ?辐射物理分会
- ?核测试与分析分会
- ?核安全分会
- ?核工程力学分会
- ?锕系物理与化学分会
- ?放射性药物分会
- ?辐照效应分会
- ?核安保分会
- ?船用核动力分会
- ?核设备分会
- ?近距离治疗与智慧放疗分会
- ?核应急医学分会
- ?射线束技术分会
- ?电离辐射计量分会
- ?核仪器分会
- ?核反应堆热工流体力学分会
- ?知识产权分会
- ?核石墨及碳材料测试与应用分会
- ?核能综合利用分会
- ?数字化与人工智能分会
- ?核环保分会
- ?高温堆分会
- ?核质量保证分会
- ?核电运行及应用技术分会
- ?核心理研究与培训分会
- ?标记与检验医学分会
- ?医学物理分会
- ?核法律分会
- ?核贸易分会
- ?研究堆与新堆分会
